Οπτική Μικροσκοπία & Κυτταρομετρία Ροής

Light Microscopy Unit & FACS-Facility

Η Μονάδα Οπτικής Μικροσκοπίας του Ελληνικού Ινστιτούτου Παστέρ (ΜΟΜ-ΕΙΠ) είναι μία από τις πιο σύγχρονες και άρτια εξοπλισμένες απεικονιστικές μονάδες Μικροσκοπίας στην Ελλάδα. Στόχος της ΜΟΜ είναι να παρέχει προηγμένες υπηρεσίες και «εργαλεία» Οπτικής Μικροσκοπίας στους επιστήμονες του ΕΙΠ καθώς και σε επιστήμονες από άλλα ερευνητικά ιδρύματα και Πανεπιστήμια.

Η ΜΟΜ στελεχώνεται από δύο έμπειρες ερευνήτριες με μεγάλη εμπειρία σε σύγχρονες τεχνικές μοριακής και κυτταρικής απεικόνισης και μια άρτια εκπαιδευμένη τεχνικό. Από το 2018, μέσω του προγράμματος της ΓΓΕΤ BIOIMAGING-GR (2018-2020) έχει γίνει πρόσληψη 3 νέων συνεργατών, μιας μεταδιδακτορικής ερευνήτριας και δύο υποψήφιων διδακτόρων.

Η ανάπτυξη της ΜΟΜ-ΕΙΠ και η εφαρμογή απεικονιστικών τεχνολογιών αιχμής, συμπληρώνονται και υποστηρίζονται από τη Μονάδα Πειραματοζώων και Διαγονιδιακής Τεχνολογίας/ Ζωϊκών Προτύπων Βιοϊατρικής Έρευνας οι οποίες σε συνδυασμό με τις Μονάδες  Βλαστοκυττάρων, Μικροχειρουργικής και Μεταμοσχεύσεων συνεισφέρουν μοναδικά στην ανάπτυξη της Μεταφραστικής Βιοϊατρικής  Έρευνας στη χώρα μας.

Η μονάδα είναι εξοπλισμένη με τρία  Συνεστιακά Μικροσκόπια, το ένα εκ των οποίων λειτουργεί και ως πολυφωτονικό και ένα μικροσκόπιο ευρέως πεδίου «Time lapse» υψηλής τεχνολογίας, με δυνατότητα βιντεοσκόπισης ζωντανών κυττάρων. Ο εξοπλισμός της Μονάδας Οπτικής Μικροσκοπίας είναι διαθέσιμος για χρήση από εξωτερικούς χρήστες από άλλα ερευνητικά ιδρύματα και πανεπιστήμια. Οι εφαρμογές μικροσκοπίας που πραγματοποιούνται στη Μονάδα είναι:

  • Μικροσκοπία φθορισμού πολλαπλών καναλιών
  • Πολυχρωματική τρισδιάστατη απεικόνιση (3D imaging)
  • Απεικόνιση ζωντανών κυττάρων μακράς διάρκειας  (long time in vivo time-lapse experiments)
  • Πολυφωτονική μικροσκοπία (2-photon microscopy)
  • Απεικόνιση νευρικού συστήματος ζωντανών πειραματοζώων (Intravital imaging)
  • Δεύτερη αρμονική απεικόνιση (second harmonic imaging)
  • Τεχνική μεταφοράς ενέργειας με συντονισμό φθορισμού [Fluorescence Resonance Energy Transfer (FRET)] για την παρακολούθηση μοριακών αλληλεπιδράσεων σε ζωντανά κύτταρα
  • Επαναφορά φθορισμού μετά από φωτολεύκανση [Fluorescence Recovery After Photobleaching (FRAP)]
  • Φασματοσκοπικός διαχωρισμός φθοριζουσών ουσιών (Spectral unmixing)
  • Επιδιόρθωση σήματος εικόνων που συλλέγονται με τη μικροσκοπία φθορισμού ευρέως πεδίου (Αποσυσχέτηση-Deconvolution)
  • Μελέτες συνεντοπισμού μορίων σε κύτταρα/ιστούς
  • Παρακολούθηση σωματιδίων (particle tracking)
  • Απεικόνιση ιόντων ασβεστίου (Calcium imaging)
  • Μικροσκοπία αντίθεσης φάσης (Phase contrast)
  • Μικροσκοπία αντίθεσης διαφορικής συμβολής (DIC-Nomarski)
  • Μέθοδοι επεξεργασίας, ανάλυσης και ποσοτικοποίησης ψηφιακής εικόνας

Εγγραφή:

Οι νέοι χρήστες της Μονάδας Μικροσκοπίας καθώς και οι παλαιότεροι χρήστες που ξεκινούν ένα νέο project πρέπει να υποβάλλουν μία περίληψη του project στη Μονάδα Μικροσκοπίας. H πληροφορία αυτή είναι απαραίτητη για εμάς για να ξεκινήσoυμε την εισαγωγική εκπαίδευση των χρηστών στα μικροσκόπια και τον χειρισμό τους καθώς και στην υποστήριξη στη μεθοδολογία που θα ακολουθηθεί για την  προετοιμασία των δειγμάτων χωρίς καθυστερήσεις.   Μπορείτε να κατεβάσετε τη φόρμα υποβολής ερευνητικού project ( LMU Project submission form ) να τη συμπληρώσετε και να τη στείλετε στο Image removed.@Image removed..

Για τους χρήστες του ΕΙΠ:

Για τους επιστήμονες του ΕΙΠ η χρήση του Συνεστιακού μικροσκοπίου και του Μικροσκοπίου Olympus IX-81 Cell R γίνεται προς το παρόν μετά από κράτηση μέσω e-mail στο group e-mail address: Image removed.@Image removed..Οι νέοι χρήστες της Μονάδας Μικροσκοπίας θα πρέπει να επικοινωνούν με το Τμήμα Μηχανογράφησης, ώστε η ηλεκτρονική τους διεύθυνση (e-mail address) να περιληφθεί στη λίστα Image removed.@Image removed.. Το πρόγραμμα για τη χρήση των μικροσκοπίων ξεκινά το νωρίτερο το μεσημέρι της Τετάρτης κάθε εβδομάδας και ισχύει για την επόμενη εβδομάδα. Ο μέγιστος χρόνος χρήσης του κάθε μικροσκοπίου ανά ημέρα είναι 4 ώρες ανά χρήστη, για μέγιστο αριθμό 2 φορών την εβδομάδα. Σε περίπτωση που δεν έχει γίνει κράτηση από άλλον χρήστη την ίδια ή άλλες μέρες ο χρόνος αυτός μπορεί να επεκταθεί. Σε περίπτωση που κάποιος χρήστης χρειάζεται να ακυρώσει το session που έχει κάνει κράτηση πρέπει να ενημερώνει εγκαίρως τους υπόλοιπους χρήστες μέσω e-mail στην ομαδική ηλεκτρονική διεύθυνση: Image removed.@Image removed.. Για τους επιστήμονες του ΕΙΠ η χρήση των μικροσκοπίων της μονάδας γίνεται χωρίς χρέωση.

Επίσης, για τη χρήση των ηλεκτρονικών υπολογιστών για ανάλυση εικόνας και ψηφιακών δεδομένων προς το παρόν πρέπει να γίνεται ενημέρωση στην υπεύθυνη τεχνικό της Μονάδας για το χρονικό διάστημα που επιθυμεί ο χρήστης να χρησιμοποιήσει τους υπολογιστές.

Για την εξοικονόμηση χρόνου ζωής  στα laser και στις λάμπες φθορισμού των μικροσκοπίων της Μονάδας, θα πρέπει τα συστήματα να μένουν όσο το δυνατόν λιγότερο χρόνο αχρησιμοποίητα από τη στιγμή που ανοίχθηκαν. Για το λόγο αυτό παρακαλούμε οι χρήστες να προγραμματίζουν έτσι το χρόνο κράτησης των μηχανημάτων, ώστε να κάνουν image acquisition για όλο το διάστημα κράτησης, χωρίς ενδιάμεσες διακοπές/διαλείμματα, όπου τα lasers του confocal και οι λάμπες φθορισμού μένουν ανοιχτά χωρίς λόγο.

Για εξωτερικούς χρήστες:

Δέσμευση του μικροσκοπίου γίνεται με τηλεφωνική επικοινωνία με την τεχνικό της Mονάδας. Συμβολική χρέωση ανά ώρα χρήσης: 30 € + ΦΠΑ.

Εκπαίδευση χρηστών:

Κάθε νέος χρήστης των δύο συστημάτων μικροσκοπίας καθώς και των λογισμικών για ανάλυση εικόνας και ψηφιακών δεδομένων της Mονάδας πρέπει να εκπαιδευτεί επαρκώς από την υπεύθυνη τεχνικό. Συγκεκριμένα ο νέος χρήστης πρέπει:

  • Να ενημερωθεί για τους κανόνες κράτησης και τις βασικές αρχές χρήσης των συστημάτων, καθώς και τις δυνατότητες που παρέχουν για τις συγκεκριμένες εφαρμογές που τον ενδιαφέρουν.
  • Nα εκπαιδευτεί από την υπεύθυνη τεχνικό της Μονάδας. στη χρήση του συστήματος που τον ενδιαφέρει και κατά τις τρεις πρώτες φορές που θα χρησιμοποιήσει το συγκεκριμένο σύστημα και μέχρι να εξοικειωθεί με τη χρήση του να πραγματοποιεί τις συνεδρίες με τη βοήθεια/ παρουσία της υπεύθυνης τεχνικού

Δημοσιεύσεις:

Στις ερευνητικές εργασίες που δημοσιεύονται και περιλαμβάνουν αποτελέσματα με τη χρήση των μικροσκοπίων ή/και προγραμμάτων ανάλυσης εικόνων της Μονάδας Οπτικής Μικροσκοπίας του ΕΙΠ, πρέπει να αναγνωρίζεται στα acknowledgments  η βοήθεια και η υποστήριξη από τη Μονάδα Οπτικής Μικροσκοπίας. Αντίγραφο της δημοσίευσης σε PDF θα πρέπει να αποστέλλεται στη Μονάδα Μικροσκοπίας.

Συνεργασίες:

Επιστημονικά projects μπορούν να πραγματοποιηθούν  σε συνεργασία με μέλη της Μονάδας Οπτικής Μικροσκοπίας του ΕΙΠ. Η συνεργασία τυπικά χαρακτηρίζεται από εντατική επιστημονική συμβολή, προετοιμασία και ανάλυση των δειγμάτων οπτικής μικροσκοπίας  ή/ και ανάπτυξη καινοτόμων απεικονιστικών πρωτοκόλλων. Σε αυτή την περίπτωση τα μέλη της Μονάδας Οπτικής Μικροσκοπίας που συμμετέχουν στην συνεργασία πρέπει να  συμμετέχουν   και στις επιστημονικές δημοσιεύσεις που θα προκύψουν.

1. Πληροφορίες για τα συστήματα απεικόνισης της μονάδας Μικροσκοπίας του ΕΙΠ:
• Leica Microsystems
• Olympus microscop

2. Χρήσιμες πληροφορίες για μεθόδους μικροσκοπίας:

• Olympus Microscopy Resource Center
• Zeiss Campus
• Molecular expressions microscopy primer
• 3D Imaging (Pawley the 39 steps) 

3. Χρήσιμες πληροφορίες για ανάλυση εικόνας:

• Imaging_Processing_Course
• fiji.sc/wiki/index.php/DetectInformationLoss
• Quantitative Imaging for Colocalization Analysis

4. Βάσεις δεδομένων φθορισμογόνων ουσιών (fluorochromes, dyes) φάσματα και κατάλληλοι συνδιασμοί φίλτρων:

• probes.invitrogen.com/resources/education/
• www.cyto.purdue.edu/flowcyt/software/Spectra.htm
• home.earthlink.net/~mpmicro/
• www.mcb.arizona.edu/IPC/spectra_page.htm

5. Χρήσιμες πληροφορίες για αποσυσχέτη Deconvolution:

• support.svi.nl/wiki/

6. Χρήσιμες πληροφορίες για FRET:

• www.kcci.virginia.edu/index.php
• www.pfid.org/html/un_fret/?en#link2

7. Πρακτικά μαθήματα Μικροσκοπίας:

• ELMI meetings
• FEBS advanced courses
• EMBO practical courses

Η ΜΟΜ του ΕΙΠ ιδρύθηκε το 2001 και από τότε οι χρήστες του εξοπλισμού των μικροσκοπίων πραγματοποίησαν ερευνητικές μελέτες που οδήγησαν σε 39 δημοσιεύσεις στις οποίες τα μέλη της μονάδας συμμετέχουν ως συγγραφείς ή έχει αναγνωρισθεί η συμβολή τους.

PUBLICATIONS
from projects carried out in HPI-LMU
Year
Exploiting the Role of Hypoxia-Inducible Factor 1 and Pseudohypoxia in the Myelodysplastic Syndrome Pathophysiology Ioanna E. Stergiou, Konstantinos Kambas, Aikaterini Poulaki, Stavroula Giannouli, Theodora Katsila, Aglaia Dimitrakopoulou, Veroniki Vidali , Vasileios Mouchtouris , Ismini Kloukina, Evangelia Xingi, Stamatis N. Pagakis, Lesley Probert , George P. Patrinos, Konstantinos Ritis, Athanasios G. Tzioufas and Michael Voulgarelis. Ιnt. J. Mol. Sci. 2021, 22, 4099. PMID: 33921064 2021
The Leishmania donovani LDBPK_220120.1 Gene Encodes for an Atypical Dual Specificity Lipid- Like Phosphatase Expressed in Promastigotes and Amastigotes; Substrate Specificity, Intracellular Localizations, and Putative Role(s)Amalia Papadaki, Olympia Tziouvara, Anastasia Kotopouli, Petrina Koumarianou, Anargyros Doukas, Pablo Rios, Isabelle Tardieux, Maja Köhn and Haralabia Boleti. Front Cell Infect Microbiol 2021 Mar 25;11:591868. doi: 10.3389/fcimb.2021.591868. PMID: 33842381 2021
Neutrophil extracellular traps in giant cell arteritis biopsies: presentation, localization and co-expression with inflammatory cytokines. Dimitris Anastasios Palamidas, Ourania D Argyropoulou, Natalia Georgantzoglou , Elli Karatza, Evangelia Xingi, Efstathia K Kapsogeorgou, Constantinos D Anagnostopoulos  ,Andreas C Lazaris , Konstantinos Ritis .Rheumatology, 2021, keab505 2021
Novel cell-based analysis reveals region-dependent changes in microglial dynamics in grey matter in a cuprizone model of demyelination.  Ilias Roufagalas, Maria Avloniti, Alexandra Fortosi, Evangelia Xingi, Dimitra Thomaidou, Lesley Probert, Vasiliki Kyrargyri. Neurobiology of Disease, 2021 Sep;157:105449. doi: 10.1016/j.nbd.2021.105449. PMID: 34274460 2021
Total Phenolic Fraction (TPF) from Extra Virgin Olive Oil: Induction of apoptotic-like cell death in Leishmania spp. promastigotes and in vivo potential of therapeutic immunomodulation. Kalliopi Karampetsou, Olga S. Koutsonι, Georgia Gogou, Apostolis Angelis, Leandros-Alexios Skaltsounis, Eleni Dotsika. PLoS Negl Trop Dis 15(1) 2021: e0008968. PMID: 33428610 2021
High Content Screening and Proteomic Analysis Identify a Kinase Inhibitor that rescues pathological phenotypes in a Patient-Derived Model of Parkinson’s Disease.  Nasia Antoniou, Kanella Prodromidou, Georgia Kouroupi, Martina Samiotaki, George Panayotou, Maria Xilouri, Leonidas Stefanis, Regis Grailhe, Era Taoufik, Rebecca Matsas. Bioarchives 2021, doi:https://doi.org/10.1101/2020.06.12.148031 2021
Increased autophagy/mitophagy levels in primary tumours of patients with pancreatic neuroendocrine neoplasms. Daskalakis K, Alexandraki KI, Kloukina I, Kassi E, Felekouras E, Xingi E, Pagakis SN, Tsolakis AV, Andreakos E, Kaltsas G, Kambas K. Endocrine 2020 May;68(2):438-447. doi: 10.1007/s12020-020-02228-1. PMID: 32114655 2020
Leishmania dual-specificity tyrosine-regulated kinase 1 (DYRK1) is required for sustaining Leishmania  stationary phase phenotype Vinícius Pinto Costa Rocha, Mariko Dacher, Simon Alan Young, Foteini Kolokousi, Antonia Efstathiou, Gerald Frank Späth, Milena Botelho Pereira Soares, Despina Smirlis. Mol Microbiol. 2020 May;113(5):983-1002. doi: 10.1111/mmi.14464. PMID: 31975452 2020
A miR-124-mediated post-transcriptional mechanism controlling the cell fate switch of astrocytes to induced-neurons. Elsa Papadimitriou, Paraskevi N. Koutsoudaki, Timokratis Karamitros, Dimitra Karagkouni, Dafni Chroni-Tzartou, Christos Gkemisis, Maria Margariti, Evangelia Xingi, Irini Thanou, Socrates J. Tzartos, Artemis G. Hatzigeorgiou, Dimitra Thomaidou. Bioarchives 2020 doi: https://doi.org/10.1101/2020.06.01.127126 2020
Combining RANK/RANKL and ERBB-2 targeting as a novel strategy in ERBB-2-positive breast carcinomas. Zoi I, Karamouzis MV, Xingi E, Sarantis P, Thomaidou D, Lembessis P, Theocharis S, Papavassiliou AG. Breast Cancer Res. 2019 Dec 3;21(1):132. doi: 10.1186/s13058-019-1226-9. PMID:31796128 2019
Estrogen receptor beta increases sensitivity to enzalutamide in androgen receptor-positive triple-negative breast cancer. Anestis A, Sarantis P, Theocharis S, Zoi I, Tryfonopoulos D, Korogiannos A, Koumarianou A, Xingi E, Thomaidou D, Kontos M, Papavassiliou AG, Karamouzis MV. J Cancer Res Clin Oncol. 2019 May;145(5):1221-1233. doi: 10.1007/s00432-019-02872-9. Epub 2019 Feb 25. PMID:30805773 2019
Heterologous expression of the mammalian sodium-nucleobase transporter SNBT1 in Leishmania tarentolae. Doukas A, Karena E, Botou M, Papakostas K, Papadaki A, Tziouvara O, Xingi E, Frillingos S, Boleti H. (2019). Biochim Biophys Acta Biomembr.1861(9):1546-1557. doi:10.1016/j.bbamem.2019.07.001.  Epub 2019 Jul 5. PMID:31283918 2019
CHUK/IKKalpha loss in lung epithelial cells enhances NSCLC growth associated with HIF up-regulation. Chavdoula E., Habiel D.M., Roupakia E., Markopoulos G.S., Vasilaki E., Kokkalis A., Polyzos A.P, Boleti H., Thanos D., Klinakis A., Kolettas E.,  Marcu K.B. (2019).  Life Science Aliance, 2(6). http://doi.org/10.26508/lsa.201900460 2019
Emerging Role of l-Dopa Decarboxylase in Flaviviridae Virus Infections.
Frakolaki E, Kalliampakou KI, Kaimou P, Moraiti M, Kolaitis N, Boleti H, Koskinas J, Vassilacopoulou D, Vassilaki N. (2019). Cells 8(8). pii: E837. doi: 10.3390/cells8080837.PMID:31387309
2019
Increased Anxiety-Related Behavior, Impaired Cognitive Function and Cellular Alterations in the Brain of Cend1-deficient Mice. Segklia K, Stamatakis A, Stylianopoulou F, Lavdas AA, Matsas R. Front Cell Neurosci. 2019 Jan 29;12:497. doi: 10.3389/fncel.2018.00497. PMID: 30760981 2019
In Vivo Phenotyping of Familial Parkinson’s Disease with Human  Induced Pluripotent Stem Cells: A Proof-of-Concept Study Ourania Zygogianni, Nasia Antoniou, Maria Kalomoiri, Georgia Kouroupi, Era Taoufik, Rebecca Matsas Vol.:(0123456789)Neurochemical Research (2019) 44:1475–1493 https://doi.org/10.1007/s11064-019-02781-w. PMID: 30989481 2019
Systemic activation of NLRP3 inflammasome in patients with severe primary Sjögren’s syndrome fueled by inflammagenic DNA accumulations. (2018). Vakrakou AG, Boiu S, Ziakas PD, Xingi EBoleti H, Manoussakis MN. J Autoimmun. Jul; 91:23-33 2018
A novel regulatory role of RGS4 in STAT5B activation, neurite outgrowth and neuronal differentiation. (2017). Pallaki P, Georganta EM, Serafimidis I, Papakonstantinou MP, Papanikolaou V, Koutloglou S, Papadimitriou E, Agalou A, Tserga A, Simeonof A, Thomaidou D, Gaitanou M, Georgoussi Z. Neuropharmacology. 1;117:408-421 2017
Neural stem/progenitor cells differentiate to oligodendrocytes and ameliorate learning deficits after transplantation in a mouse model of traumatic brain injury. (2016). P. N. Koutsoudaki, F. Papastefanaki, A. Stamatakis, Georgia Kouroupi, E. Xingi, F.Stylianopoulou, & R. Matsas. Glia, 64(5):763-79. 2016
The Leishmania donovani histidine acid ecto-phosphatase LdMAcP: insight into its structure and function. (2015). Papadaki A, Politou AS, Smirlis D, Kotini MP, Kourou K, Papamarcaki T, Boleti H . Biochem J. 1;467(3):473-86 2015
New labeled derivatives of the neuroprotective peptide colivelin: synthesis, characterization, and first in vitro and in vivo applications. (2015). Kostomoiri M, Zikos C, Benaki D, Triantis C, Sagnou M, Paravatou-Petsotas M, Papadaki A, Boleti H, Papadopoulos M, Pirmettis I, Pelecanou M, Livaniou E. Arch Biochem Biophys. 1;567:83-93 2015
CEND1 and NEUROGENIN2 Reprogram Mouse Astrocytes and Embryonic Fibroblasts to Induced Neural Precursors and Differentiated Neurons. (2015). Aravantinou-Fatorou K, Ortega F, Chroni-Tzartou D, Antoniou N, Poulopoulou C, Politis PK, Berninger B, Matsas R, Thomaidou DStem Cell Reports.5(3):405-18 2015
A mutagenesis method for the addition and deletion of highly repetitive DNA regions: the paradigm of EPIYA motifs in the cagA gene of Helicobacter pylori. (2013). Papadakos KS, Sougleri IS, Mentis AF, Sgouras DN. Helicobacter. 18(3):229-41 2013
Eisosome distribution and localization in the meiotic progeny of Aspergillus nidulans. (2013). Athanasopoulos A, Boleti H, Scazzocchio C, Sophianopoulou V. Fungal Genet Biol. 53:84-96 2013
Functional Interactions between BM88/Cend1, Ran-Binding Protein M and Dyrk1B Kinase Affect Cyclin D1 Levels and Cell Cycle Progression/Exit in Mouse Neuroblastoma Cells. (2013). Tsioras K, Papastefanaki F, Politis PK, Matsas R, Gaitanou M. PLoS One. 8(11):e82172 2013
Subventricular zone-derived neural stem cell grafts protect against hippocampal degeneration and restore cognitive function in the mouse following intrahippocampal kainic acid administration. (2013). Miltiadous P, Kouroupi G, Stamatakis A, Koutsoudaki PN, Matsas R, Stylianopoulou F. Stem Cells Transl Med. 2(3):185-98 2013
Cell surface Cdc37 participates in extracellular HSP90 mediated cancer cell invasion. (2012). El Hamidieh A, Grammatikakis N, Patsavoudi E. PLoS One 7(8):e42722. 2012
The 4C5 cell-impermeable anti-HSP90 antibody with anti-cancer activity, is composed of a single light chain dimer. (2011). Sidera K, El Hamidieh A, Mamalaki A, Patsavoudi E. PLoS One 6(9):e23906 2010
Lentivirus-mediated expression of insulin-like growth factor-I promotes neural stem/precursor cell proliferation and enhances their potential to generate neurons. (2010). Kouroupi G, Lavdas A, Gaitanou M,, Thomaidou D, Stylianopoulou F and Matsas R. J. of Neurochemistry 115(2):460-74. 2010
Soluble forms of the cell adhesion molecule L1 produced by insect and baculovirus-transduced mammalian cells enhance Schwann cell motility. (2010). Lavdas A, Efrose R,Douris V , Gaitanou M, Swevers L, Thomaidou D, Iatrou K and Matsas K. J. of Neurochemistry 115(5):1137-49 2010
ER targeting and retention of the HCV NS4B protein relies on the concerted action of multiple structural features including its transmembrane domains. (2010)Boleti H., Smirlis D., Dalagiorgou G., Meurs E., Christoforidis S., & Mavromara.P. Mol. Memb. Biol27(1):50-74 2010
Cloning and functional characterization of LjPLT4, a plasma membrane xylitol H+– symporter from Lotus japonicus. (2010). Kalliampakou Κ. Kouri Ε., Boleti H., Pavli O., Maurousset L.,Udvardi M., Katinakis P., Rémi Lemoined, and Flemetakis E. Mol. Membr. Biol. 28(1):1-13 https://doi.org/10.3109/09687688.2010.500626 2010
Endocytosis of hepatitis C virus non-enveloped capsid-like particles induces MAPK-ERK1/2 signalling events. (2010). K. Katsarou, A. Α. Lavdas, P. Tsitoura, E. Serti, P. Markoulatos, P. Mavromara & U. Georgopoulou. Cell Mol Life Sci. 67(14):2491-506 2010
Schwann cells engineered to express the cell adhesion molecule L1 accelerate myelination and motor recovery after spinal cord injury. (2010). A. A Lavdas, J. Chen, F. Papastefanaki, S. Chen, M.Schachner, R.Matsas, D. ThomaidouExp Neurol. 221 206–216 2010
Transplantation of embryonic neural stem/ precursor cells overexpressing BM88/Cend1 enhances the generation of neuronal cells in the injured mouse cortex. (2010). G. Makri, A. A. Lavdas, L. Katsimpardi, P. Charneau, D. Thomaidou and Rebecca Matsas. Stem Cells. 28(1):127-39 2010
Leishmania donovani Ran-GTPase interacts at the nuclear rim with linker histone H1. Smirlis D, Boleti H, Gaitanou M, Soto M, Soteriadou K. (2009)Biochem J. 10;424(3):367-74 2010
6-Br-5methylindirubin-3’oxime (5-Me-6-BIO) targeting the leishmanial glycogen synthase kinase-3 (GSK-3) short form affects cell-cycle progression and induces apoptosis-like death: exploitation of GSK-3 for treating leishmaniasis. (2009). Xingi E, Smirlis D, Myrianthopoulos V, Magiatis P, Grant KM, Meijer L, Mikros E, Skaltsounis AL, Soteriadou KInt J Parasitol. 39(12):1289-303 2009
Green fluorescent protein – Tagged HCV non-enveloped capsid like particles: development of a new tool for tracking HCV core uptake(2009). Katsarou K, Serti E, Tsitoura P, Lavdas AA, Varaklioti A, Pickl-Herk AM, Blaas D, Oz-Arslan D, Zhu R, Hinterdorfer P, Mavromara P, Georgopoulou U. Biochimie. 91(7):903-15 2009
Neuronal I kappa B kinase beta protects mice from autoimmune encephalomyelitis by mediating neuroprotective and immunosuppressive effects in the central nervous system. (2009). Emmanouil M, Taoufik E, Tseveleki V, Vamvakas SS, Tselios T, Karin M, Lassmann H, Probert L. J Immunol. 183(12):7877-89 2009
BM88/Cend1 regulates stimuli-induced intracellular calcium mobilization. (2009). Masgrau R, Hurel C, Papastefanaki F, Georgopoulou N, Thomaidou D, Matsas R. Neuropharmacology 56(3):598-609 2009
Incorporation of the Arc1p tRNA-binding domain to the catalytic core of MetRS can functionally replace the yeast Arc1p-MetRS complex. (2008). Karanasios E, Boleti H, Simos G. J Mol Biol. 381(3):763-71 2008
Expression studies of the HCV-1a core+1 open reading frame in mammalian cells. (2008). Vassilaki N, Boleti H, Mavromara P. Virus Res. 133(2):123-35 2008
Deleted in Azoospermia-Like (DAZL) gene expressing cells in human amniotic fluid: a new source for germ cells research? (2008). K.Stefanidis, D. Loutradis, L. Koumbi, V.Anastasiadou, V. Dinopoulou, E. Kiapekou, A. A. Lavdas, S. Mesogitis, A. Antsaklis. Fertil Steril. 90(3):798-804 2008
BM88/Cend1 expression levels are critical for proliferation and differentiation of subventricular zone-derived neural precursor cells. (2008). Katsimpardi L, Gaitanou M, Malnou CE, Lledo PM, Charneau P, Matsas R, Thomaidou D. Stem Cells. 26(7):1796-807 2008
A critical role for HSP90 in cancer cell invasion involves interaction with the extracellular domain of HER-2. (2008). Sidera K, Gaitanou M, Stellas D, Matsas R, Patsavoudi E. J Biol Chem. 283(4):2031-41. 7.716 2008
In vitro activity of 10-deacetylbaccatin III against Leishmania donovani promastigotes and intracellular amastigotes. (2007). Georgopoulou K, Smirlis D, Bisti S, Xingi E, Skaltsounis L, Soteriadou K. Planta Med. 73(10):1081-8 2007
Expression studies of the core+1 protein of the hepatitis C virus 1a in mammalian cells: the influence of the core protein and proteasomes on the intracellular levels of core+1. (2007). Vassilakι Ν, Boleti Η., Mavromara P. FEBS J. 274(16):4057-74 2007
Grafts of Schwann cells engineered to express PSA-NCAM promote functional recovery after spinal cord injury. (2007). F. Papastefanaki, J. Chen, A. A. Lavdas, D. Thomaidou, M. Schachner and R. Matsas. Brain. 130(Pt 8):2159-74 2007
BM88/CEND1 coordinates cell cycle exit and differentiation of neuronal precursors. (2007). Politis PK, Makri G, Thomaidou D, Geissen M, Rohrer H, Matsas R. Proc Natl Acad Sci USA;104(45):17861-6 2007
Leishmania histone H1 overexpression delays parasite cell-cycle progression, parasite differentiation and reduces Leishmania infectivity in vivo. (2006). Smirlis D, Bisti SN, Xingi E, Konidou G, Thiakaki M, Soteriadou KP. Mol Microbiol. 60(6):1457-73 2006
Schwann cells genetically engineered to express PSA show enhanced migratory potential without impairment of their myelinating ability. (2006)A. A Lavdas, I. Franceschini, M. Dubois-Dalcq, R. Matsas. Glia 53(8): 868-78 2006
Baculovirus-mediated gene delivery into Mammalian cells does not alter their transcriptional and differentiating potential but is accompanied by early viral gene expression. (2006).
C Kenoutis, R C Efrose, L Swevers, A A Lavdas, M Gaitanou, R Matsas, K Iatrou. J. of Virol. 80(8):4135-46
2006
BM88 is a dual function molecule inducing cell cycle exit and neuronal differentiation of neuroblastoma cells via cyclin D1 down-regulation and retinoblastoma protein hypophosphorylation. (2006). Georgopoulou N1, Hurel CPolitis PKGaitanou MMatsas RThomaidou D. J Biol Chem. 281(44):33606-20 2006
BM88 is an early marker of proliferating precursor cells that will differentiate into the neuronal lineage. (2004). Koutmani Y, Hurel C, Patsavoudi E, Hack M, Gotz M, Thomaidou D, Matsas R. Eur J Neurosci. 20(10):2509-23 2004
Expression of a novel Leishmania gene encoding for an histone H1-like protein in L. major modulates Leishmania infectivity in vitro. (2002). F. Papageorgiou and K. Soteriadou. Infect. Immun. 70, 6976-6986 2002

Οι Επιστήμονες που υποστηρίζουν την ΜΟΜ του ΕΙΠ έχουν συμμετάσχει είτε ως μέλη είτε ως επιστημονικοί υπεύθυνοι σε αρκετές αιτήσεις επιχορήγησης που κατάφεραν να προσελκύσουν χρηματοδότηση για τη ΜΟΜ είτε για την οργάνωση επιμορφωτικών σεμιναριακών μαθημάτων είτε για την αναβάθμιση του εξοπλισμού και την ανάπτυξη νέας μεθοδολογίας από τις ακόλουθες επιχορηγήσεις:

  • ΒΙΟΙΜAGING GR 2018-2020: “Hellenic Research Infrastructure for the Imaging and Observation of Fundamental Processes in Biology and Medicine” (MIS 5002755) which is implemented under the Action “Reinforcement of the Research and Innovation Infrastructure”, funded by the Operational Programme “Competitiveness, Entrepreneurship and Innovation” (NSRF 2014-2020) and co-financed by Greece and the European Union (European Regional Development Fund, coordinator Dr. Tavernarakis, IMBB Forth).
  • Stavros Niarchos Foundations Sponsorships 2016-2020: «Development of innovative Biological products and health services for infectious and neurodegenerative diseases» (Coordinators Drs. R. Matsa and V. Myriagou)
  • Ηellenic State Scholarship Foundation (Ι.Κ.Υ.) and German Burau for Academics’ Exchanges (DAAD): IKYDA program 2014-2015: Astroglia activation and reprogramming in brain injury and repair: analysis by in vivo imaging (2P-LSM) of the brain (Scientific Responsible Dr. D. Thomaidou).
  • RIIP (Institut Pasteur International Network) International course 2016 :
    ” Cell Biology and infection: Digital Image Processing/Analysis Tools for Quantitative Light Microscopy Imaging”. Scientific Responsible Dr. H. Boleti
  • FP7 EU program 264083 NEUROSIGN 2010-2013: Development of Centre of Excellence in Neurosciences (cordinators. Dr.S. Tzartos– Dr. R. Matsa & Dr. L. Probert (Dr. D. Thomaidou Responsible for WP of purchasing the Infrastructure equipment for in vivo imaging).
  • RIIP (Institut Pasteur International Network) Regional course 2013:
    “Digital image processing/analysis tools in Light Microscopy: From the basics and beyond”. Scientific Responsible Dr. H. Boleti
  • Competitive grant from the Greek General Secretariat of Research and Technology in the context οφ European program “Human Networks for training in Research and Technology” 2004-2006 –Establishment of the Greek Light Microscopy Network Title: “Applications of Light Microscopy in Biomedical research and Diagnosis” In colaboration with the U. of Ioannina & U. of Crete Coordinator of the project and of the Network, HPI-LMU. (Scientific Responsible ¨Drs H. Boleti & D. Thomaidou)
Μέλη
ΚΥΤΤΑΡΟΜΕΤΡΙΑ ΡΟΗΣ
Οι εγκαταστάσεις της Κυτταρομετρίας Ροής (FACS) FACS του ΕΙΠ υποστηρίζονται από μια ερευνήτρια και μια τεχνικό που παρέχουν επιστημονικές συμβουλές και τεχνική βοήθεια στους χρήστες. Τα όργανα της εγκατάστασης FACS χρησιμοποιούνται από ερευνητές του Ινστιτούτου για πολλαπλές μελέτες, όπως ο διαχωρισμός κυτταρικών πληθυσμών και η ανίχνευση αρκετών παραμέτρων με φθορισμό καθώς και μορφολογικά χαρακτηριστικά των κυττάρων με πρόσθια και πλευρική σκέδαση (FSC & SSC) για μελέτη των χαρακτηριστικών κυττάρων του ανοσοποιητικού συστήματος καθώς και άλλων κυτταρικών πληθυσμών, την ανίχνευση απόπτωσης, τον κυτταρικό θάνατο, την ανάλυση κυτταρικού κύκλου, την κυτταρική διαίρεση κλπ.